Rada podtrzymała negatywne stanowisko w stosunku do zaproponowanych przez Ministerstwo Finansów wymagań realizowania przemieszczeń w systemie EMCS wyłącznie z zastosowaniem bezpiecznego podpisu elektronicznego weryfikowanego przy pomocy kwalifikowanego certyfikatu przypisanego do użytkownika.

Zdaniem PKPP Lewiatan, przyjęcie propozycji Ministerstwa Finansów będzie się wiązało z koniecznością poniesienia dodatkowych kosztów. Będą musiały zostać przeprowadzone także dodatkowe zmiany w systemach, które – w opinii środowiska przedsiębiorców – będą miały negatywny wpływ na terminowe wdrożenie integracji z systemem EMCS PL.

Zwrócono również uwagę na problem, który wiąże się z wdrożeniem systemu EMCS i spodziewanym w związku z tym przyśpieszeniem wymiany danych dotyczących przesyłek pomiędzy państwami wysyłki i odbioru przemieszczanych wyrobów akcyzowych z zastosowaniem procedury zawieszonego poboru podatku akcyzowego.

W przypadku stwierdzenia ponadnormatywnych ubytków, informacja ta będzie dostępna dla administracji kraju wysyłki i odbioru o wiele szybciej niż do tej pory, co w przypadku polskich podatników może spowodować, że pomimo zapłaty podatku od ponadnormatywnego ubytku w Polsce, zostaną wezwani do zapłaty podatku z tego samego tytułu także przez władze celne kraju odbioru przesyłki.

Od 1 kwietnia 2010 r. państwa członkowskie, które posiadają gotowy system EMCS, dokonują przemieszczania wyrobów akcyzowych w procedurze zawieszenia poboru akcyzy za pomocą elektronicznego dokumentu e-AD. Dania i Polska zadeklarowały uruchomienie systemu 1 stycznia 2011 r.

T.Sz., MF, PKPP Lewiatan