W gospodarstwach należących do 83,7 tys. rolników, którzy złożyli wnioski o płatności bezpośrednie do gruntów rolnych, kontrola zostanie przeprowadzona metodą inspekcji terenowej, a w przypadku 25,1 tys. – metodą FOTO. Pierwsza metoda polega na przeprowadzeniu wywiadu terenowego i pomiarów na polu co najmniej 50 proc. ogólnej liczby działek rolnych zadeklarowanych przez producenta we wniosku,  z wykorzystaniem GPS. W przypadku stwierdzenia nieprawidłowości, zakres kontroli jest rozszerzany do 100 proc. powierzchni działek rolnych.

Kontrola metodą FOTO jest przeprowadzana na podstawie ortofotomapy (cyfrowe odwzorowanie terenu wykonane na podstawie zdjęć lotniczych lub satelitarnych) i na podstawie wywiadu terenowego. Kontrole z zastosowaniem tej metody zostaną przeprowadzone przede wszystkim na obszarach, na których stwierdzone zostały w poprzednich latach znaczące nieprawidłowości. Wytypowano do nich 30 obszarów w 11 województwach. Wszystkie gospodarstwa wytypowane do kontroli metodą FOTO oraz minimum 1 proc. wytypowanych do kontroli metodą inspekcji terenowej będą poddane kontroli spełnienia warunków dobrej kultury rolnej.

W roku 2007 wnioski o dopłaty bezpośrednie złożyło blisko 1,5 mln producentów. W skali kraju przeprowadzono ok. 106 tys. kontroli z tytułu płatności bezpośrednich. Na podstawie analizy danych za 2007 rok oszacowano, że poziom nieprawidłowości przekraczających 3 proc. powierzchni deklarowanej w stosunku do powierzchni stwierdzonej wystąpił w prawie 17 proc. gospodarstw.

T.Sz., ARiMR